培养颗粒污泥首先对基质有着一定的要求，一般的，在培养颗粒污泥的基质当中COD：N：P=110~200：5：1，而有机废液的基质可以分为偏碳水化合物类与偏蛋白质类。为了能够顺利培养出颗粒污泥，对于偏碳水化合物类的污水需要添加N与P，而对于那些偏蛋白质类的污水需要添加碳源（如葡萄糖等）。有学者研究表明，不添加碳源，颗粒污泥的形成比较困难。可见，适当比例的碳源对促成颗粒污泥形成是必要的。废水中的厌氧处理主要是依靠微生物的生命活动来达到处理的目的，不同的微生物生长也需要不同的温度范围。温度稍微有几度的差别，就可能在两类主要种群之间造成不平衡。

因此，温度对颗粒污泥的培养是很重要。颗粒污泥在低温（15~25℃）、中温（30~40℃）和高温（50~60℃）都有过成功的经验。一般的，高温较中温的培养时间比较短，但由于高温下NH3与某些化合物混合毒性会增加，因而导致其应用上受一定的限制；中温一般控制在35℃左右，在其它条件适当的情况下，经1~3个月可成功的培养出颗粒污泥；低温下培养颗粒污泥的研究较少，但有文献报道在使用颗粒污泥低温驯化后处理底浓度制药废水的实验中，COD的去处率达90%，取得了较好的效果[2].因而低温培养颗粒污泥将是今后的研究的重点之一。
厌氧处理过程中，水解产酸菌对pH值有较大的适应范围，而产甲烷菌则对pH值的变化敏感，其最适pH值范围是6.8-7.2，如果反应器内的pH值超过这个范围。则会导致产甲烷菌受到抑制，并出现酸积累，进而使整个反应器酸化。因此，反应器内pH值范围应控制在产甲烷菌最适的范围内。由于不同性质的废水有不同的pH值，为了保证反应器内pH值的稳定，防止酸积累而产生的对产甲烷菌的抑制，可采用向废水中添加化学药品如NaHCO3、Na2CO3、Ca（OH）2等物质。